3 września 1939 roku do wsi wkroczyły oddziały Wehrmachtu, podpalając zabudowania. Żołnierze niemieccy zamordowali wówczas 20 mieszkańców Łobodna oraz spalili 99 budynków mieszkalnych i gospodarczych. Zdołano ustalić tożsamość 3 zabitych, byli to: Adam Galle (20 lat), Maria Galle (50 lat) i Ignacy Galle (50 lat). Poza nimi zamordowano 5 osób pochodzenia żydowskiego i 12 osób, które przypadkowo znalazły się w wiosce i nie były jej mieszkańcami. Nie ustalono ich personaliów. We wsi działali żołnierze Batalionów Chłopskich. W okresie okupacji niemieckiej wieś została włączona do III Rzeszy. 2 czerwca 1944 żandarmeria niemiecka i oddziały SS dokonały pacyfikacji Łobodna, za pomoc partyzantom rozstrzelano 10 osób. Zabici zostali: Józef Barchold (25 lat), Piotr Barchold (49), Franciszek Kątny (51), Józef Kątny (20) syn Franciszka, Stanisław Kątny (38), Zygmunt Kątny (20) syn Stanisława, Bronisław Łada (28), Katarzyna Olszewska (66), Andrzej Słonina (38), Jan Wośtak (35). Zwłoki pomordowanych zostały przewiezione furmankami do Kłobucka i pochowane na cmentarzu parafialnym.