W 1945 Mikołajki znalazły się w granicach Polski. Początkowo wraz z całym powiatem sztumskim wchodziły w skład warmińsko-mazurskiego okręgu administracyjnego, a od 7 lipca 1945 w skład województwa gdańskiego. Uchwałą z 4 grudnia 1972 powołana została gmina Mikołajki Pomorskie, która po reformie administracyjnej w 1975 znalazła się w granicach województwa elbląskiego, a od 1999 wchodzi w skład województwa pomorskiego. Od 2002 gmina należy do powiatu sztumskiego (po wydzieleniu go z powiatu malborskiego, istniejącego od 1999).
Zabytki mały|Kościół rzymskokatolicki św. Antoniego Padewskiego Według rejestru zabytków NID na listę zabytków wpisane są: kościół parafialny pw. św. Antoniego Padewskiego, ul. Kościuszki / Kościelna, 1896, nr rej.: A-1420 z 20.10.1993 cmentarz przykościelny, nr rej.: j.w. kapliczka, nr rej.: j.w.
Gospodarka W centrum Mikołajek Pomorskich znajduje się szereg sklepów spożywczych, odzieżowych, przemysłowych i mięsnych.