do rodziny zaliczone zostały głównie rodzaje stanowiące opisane dalej plemię Melianthieae, natomiast w systemie Takhtajana do rodziny zaliczone zostały 4 plemiona: Xerophylleae, Melanthieae, Heloniadeae i Chionographideae. W najnowszych systemach należące tu rośliny łączone są w randze rodziny w ramach rzędu liliowców (system APG, APG II, APG III, APG IV i system Reveala z 2007 r.), a do rodziny zaliczono w randze podrodziny Parideae dawny rząd trójlistowców (Trilliales).
Powiązania filogenetyczne w obrębie rodziny Relacje filogenetyczne w obrębie rodziny pozostają niejasne i są wciąż przedmiotem intensywnych badań. Badania molekularne wykazały, że opisywane na podstawie cech morfologicznych rodzaje są w istocie taksonami parafiletycznymi i tworzą kompleksy (np. Veratrum-Melanthium, Zigadenus-Amianthium).
Prawdopodobne powiązania filogenetyczne między plemionami melantkowatych:
Podział systematyczny podrodzina Melanthieae Amianthium A.Gray – bezplamka Anticlea Kunth Melanthium L. (nazwa traktowana też jako synonim Veratrum s.l.