Gardyńskiego do ujścia.
Przyroda i jakość wód W rzece występują: grążel żółty Nuphar lutea, grzybienie białe Nymphaea alba, osoka aloesowata Stratiotes aloides, strzałka wodna Stagittaria sagittifolia, Hildenbrandtia rivularis porastający kamienie, gąbka słodkowodna Spongilla lacustris. Litoral zajmują zbiorowiska szuwarowe z trzciną pospolitą Phragmites australis, mozgą trzcinową Phalaris arundinacea, pałką szerokolistną Typha latifolia.
W czasie badań na potrzeby monitoringu jakości wód na stanowisku w Iznocie w 2024 roku wśród makrofitów największy udział miała manna mielec, a wśród okrzemek bentosowych Planothidium rostratum.
W 2012 roku stan ekologiczny Krutyni sklasyfikowano jako dobry. Taką klasę uzyskały badane wówczas elementy biologiczne (fitoplankton, makrobezkręgowce bentosowe i makrofity) i część parametrów fizykochemicznych. Większość elementów fizykochemicznych, m.in BZT5, przewodność, azot, fosfor, uzyskała stan bardzo dobry. Spośród badanych wówczas substancji priorytetowych żadna nie przekroczyła norm, a większość nie osiągnęła stężenia sięgającego poziomu oznaczalności. Podobny stan stwierdzono w latach 2021–2024.
Właściwy bieg rzeki Bieg rzeki przedstawiono od dołu do góry. Drukiem wytłuszczonym zaznaczono nurt główny rzeki, zwykłym dopływy.