Od północy obszar otaczają wzniesienia Gabrk, Čebulovica i Vremščica, natomiast od wschodu i południa sąsiaduje on z fliszowymi wzgórzami Brkini. Najbliższą większą miejscowością jest Divača, położona na północny zachód od centrum informacyjnego parku w Matavunie.
Chroniony obszar Parku Jaskiń Szkocjańskich obejmuje 413 ha. Strefa oddziaływania parku obejmuje natomiast całe dorzecze Reki o powierzchni około 450 km², rozciągające się od masywu Snežnik po obszar, na którym rzeka znika w krasowym podłożu.
Geologia i powstanie jaskiń
System powstał w wapieniach kredowych i paleoceńskich, znajdujących się w pobliżu granicy z nieprzepuszczalnymi skałami fliszowymi eocenu. Wody Reki i jej dopływów gromadzą się na obszarze fliszowym, a po wpłynięciu na wapienne podłoże przenikają do systemu krasowego.
Na kierunek i kształt korytarzy wpływały uławicenie wapieni, spękania tektoniczne oraz strefy uskokowe. Reka pogłębiała podziemne korytarze zarówno przez erozję mechaniczną, jak i przez chemiczne rozpuszczanie skał węglanowych.
Starsze partie systemu znajdują się na wyższych poziomach i stanowią pozostałość wcześniejszych dróg przepływu rzeki. Do takich fragmentów należą m.in.