Wkrótce Agent 47 w pełni powraca do dawnej profesji. Na początek jedzie do Petersburga, gdzie zabija czterech rosyjskich generałów: Rinata Rumiancewa podczas spotkania z kilkoma innymi wojskowymi w jednym z budynków w centrum miasta, Makarowa podczas spotkania z mafijnym kontaktem Igorem Kubaską w Parku Kirowa, Michaiła Bardaczenkę w tajnym, podziemnym bunkrze (przy okazji uwalnia także więzionego tam agenta Smitha, z którym wcześniej zetknął się w restauracji w Hongkongu i szpitalu psychiatrycznym w Rumunii) i Władimira Żupikowa podczas przyjęcia w ambasadzie Niemiec. Następnie jedzie do Japonii, w której zabija handlarza bronią Masahiro Hayamoto (aby ustalić miejsce pobytu Hayamoto – stary zamek w górach w środkowej Japonii – najpierw musiał zabić jego syna i umieścić w jego ciele nadajnik GPS) i do Malezji, gdzie w piwnicy budynku centrum finansowego w Kuala Lumpur eliminuje, jak początkowo sądził, Charliego Sidjana, hakera oskarżanego o kradzież amerykańskiego oprogramowania wojskowego. Po zabójstwie Agent 47 dowiaduje się jednak, że w rzeczywistości pozbawił życia brata bliźniaka Sidjana.