Po otrzymaniu informacji od przebywającego na miejscu agenta Smitha Hitman udaje się do gurudwary, gdzie zabija propagandzistkę grupy kultu i osobistą lekarkę Ji, doktor von Kamprad, a następnie na Wyspę Szpitalną, na której w podziemnym kompleksie szpitalnym podstępnie uśmierca przywódcę grupy kultu, leżącego na stole operacyjnym przed planowaną operacją serca. Później, w trakcie ucieczki z wyspy Agent 47 zostaje zaatakowany przez podobnego do siebie łysego człowieka, jednak skutecznie odpiera jego atak i ucieka.
Wkrótce po zabójstwie Deewany Ji agencja dowiedziała się, że wszystkie dotychczasowe misje Agenta 47 zlecał ten sam klient, Siergiej Zaworotko, który okazał się być ogólnoświatowym terrorystą i handlarzem bronią. Wszystkimi celami Hitmana były osoby, które w różny sposób były zaangażowane w transakcję dotyczącą dwóch głowic jądrowych, niedawno zakupionych przez Zaworotkę, a przesyłka, którą Hitman miał „odzyskać” w Nurestanie zawierała komponenty głowic, które Zaworotko planował sprzedać indyjskiej sekcie. Głowice te posiadały oprogramowanie sygnatury klucza, oszukującego amerykański system obrony przeciwrakietowej, a Zaworotko, który miał powiązania z rosyjskim rządem i wojskiem, musiał wyeliminować wszystkich zaangażowanych w transakcję, dlatego jako klient zaoferował kontrakty Agentowi 47.