Niemcy na mocy tego rozporządzenia skonfiskowali zbiory muzeum, które mieściło się w renesansowym pałacu obronnym w Gołuchowie, a także zbiory muzeum na zamku w Kórniku oraz zbiory zgromadzone przez Raczyńskich w pałacu w Rogalinie .
Okres PRL Po wojnie zespół pałacowo-parkowy i kaplica z mauzoleum były przez wiele lat zaniedbane. Doraźne remonty przeprowadzono w latach 1975–2000, ale wciąż tylko część wnętrz była dostępna dla zwiedzających.
W latach 1975–1998 miejscowość położona była w województwie poznańskim. W 1975 roku kaplica z mauzoleum Raczyńskich stała się siedzibą parafii pw. św. Marcelina.
III RP Po upadku komunizmu, ostatni właściciel majątku Rogalin, Edward Bernard Raczyński (przy pełnej aprobacie swoich trzech córek) założył pod koniec 1990 r. Fundację im. Raczyńskich przy Muzeum Narodowym w Poznaniu i przekazał jej pałac i park w Rogalinie, Galerię Rogalińską oraz przysługujące mu prawa do ziem otaczających pałac i park (choć nadal prawnie nie są one własnością Fundacji).
W latach 2007–2009 oraz 2013-2015 dokonano kompleksowej rewaloryzacji i modernizacji pałacu, która umożliwiła wyposażenie pozostałych wnętrz i udostępnienie zwiedzającym całego pałacuStrona internetowa Muzeum Pałac w Rogalinie..