Młynkowo – wieś w Polsce położona w województwie wielkopolskim, w powiecie szamotulskim, w gminie Duszniki. Przez wieś przepływa Mogilnica.
Historia Miejscowość pierwotnie była związana z Wielkopolską. Istnieje co najmniej od pierwszej połowy XV wieku i ma średniowieczną metrykę. Pierwszy zachowany zapis pochodzi z łacińskiego dokumentu z 1415 gdzie odnotowano ją jako „Mlinkowo”, 1564 „Mlinkouo, Mlynkovo”.
Tereny, na których powstała miejscowość były jednak zasiedlone znacznie wcześniej. Około jednego kilometra na północ od wsi, 100 metrów na wschód od brzegu rzeki Mogilnicy, archeolodzy odnaleźli wczesnośredniowieczne, czworoboczne grodzisko stożkowate datowane na VI-X wiek oraz pozostałości osady przygrodowej.
Początkowo wieś była własnością kościelną należącą do biskupów poznańskich leżącą w kluczu bukowskim. W 1510 miejscowość leżała w powiecie poznańskim województwa poznańskiego w Koronie Królestwa Polskiego i należała do parafii Wilczyna.
Pierwszy zapis pochodzi ze źródeł kościelnych.