Jednak projekty kościołów ustępują pod względem oryginalności kamienicom. Talowski wziął udział w konkursie na budowę kościoła św. Elżbiety we Lwowie, podczas którego dwie z trzech wersji jego projektów otrzymały pierwszą nagrodę. Jedną wersję zrealizowano w latach 1903–1911 we Lwowie, a drugą w Tarnopolu pod wezwaniem Matki Bożej Nieustającej Pomocy. Jego projekt lwowskiego kościoła św. Elżbiety manifestował przywiązanie lwowskiego środowiska architektów do stylu przejściowego wobec ofensywy stylu narodowego.
W 1897 stary kościół w Dobrzechowie (XV w.) został wyburzony; w 1905 Talowski powstrzymał rozbiórkę zabytkowego kościoła pw. św. Mikołaja w Wyżnianach (ok. 1400), zaplanowaną na podstawie ekspertyzy Michała Kowalczuka.
Jednym z ostatnich dzieł Teodora Talowskiego jest kościół w Kraczkowej, zaprojektowany pod koniec 1909 roku. Projekt nie uzyskał akceptacji władz kościelnych, które nakazały wprowadzenie istotnych zmian (m.in. usunięcie wieżyczek), jednak mieszkańcy zignorowali te żądania i budowę dokończono zgodnie z projektem.