W przedniej części podwzgórza znajdują się jądra: płciowodwupostaciowe nadwzrokowe przykomorowe nadskrzyżowaniowe
W części środkowej (guzowej) znajdują się jądra: brzuszno-przyśrodkowe grzbietowo-przyśrodkowe guzowo-suteczkowe łukowate
W części bocznej znajduje się jądro: boczne
W części tylnej (sutkowatej) znajdują się jądra: suteczkowe przyśrodkowe suteczkowe boczne przedsuteczkowe tylne
Neurotransmitery podwzgórza Neurony podwzgórza syntetyzują około 20 ważnych związków o właściwościach hormonów lub neuroprzekaźników.
Neuroprzekaźniki: noradrenalina dopamina serotonina acetylocholina glutaminian GABA Neuropeptydy: wazopresyna oksytocyna kortykoliberyna tyreoliberyna neuropeptyd Y leptyna oraz tlenek azotu.
Hormony podwzgórza Hormony biorące udział w regulacji wydzielania przedniego płata przysadki: kortykoliberyna tyreoliberyna gonadoliberyna somatoliberyna somatostatyna prolaktoliberyna prolaktostatyna
Hormony biorące udział w regulacji wydzielania pośredniego płata przysadki:
melanoliberyna melanostatyna
Wydzielane hormony magazynowane w tylnym płacie przysadki:
wazopresyna oksytocyna