Sewel górski jest jedynym żyjącym współcześnie przedstawicielem rodziny sewelowatych. Rodzina ta, wraz z pokrewnymi rodzinami wiewiórkowatych i popielicowatych, zalicza się do podrzędu wiewiórkokształtnych w rzędzie gryzoni. Granice zasięgu podgatunków A. rufa zostały zrewidowane w oparciu o badaniu genetyki populacji. Analizy filogenetyczne wykazały, że wcześniej rozpoznany podgatunek rainieri był zagnieżdżony w obrębie podgatunku rufa, ale podgatunek rufa na północ od rzeki Kolumbia stanowił odrębną populację od tych na południe, co doprowadziło do odrodzenia się podgatunku olympica. W analizach tych zrewidowano również granice geograficzne podgatunku pacifica. Autorzy Illustrated Checklist of the Mammals of the World rozpoznają siedem podgatunków. Podstawowe dane taksonomiczne podgatunków (oprócz nominatywnego) przedstawia poniższa tabelka:
Wyróżnia się siedem podgatunków sewela górskiego: Podgatunek Oryginalna nazwa Autor i rok opisu Miejsce typowe HolotypA. r. californicaHaplodon leporinus var. Californicus(W.C.H. Peters, 1864)Sierra Nevada, Kalifornia, Stany Zjednoczoneczaszka i skóra ze zbiorów Muzeum Historii Naturalnej w Berlinie.A. r. humboldtianaAplodontia humboldtianaW.P.