Bauer, biegnący na drugiej zmianie, wyprowadził czeską drużynę z szóstego na trzecie miejsce, a Koukal był nawet na drugim miejscu, jednak na finiszu Norweg Petter Northug wyprzedził Czecha o zaledwie 0,3 sekundy. Był też siódmy w biegu łączonym oraz dwunasty na dystansie 50 km stylem klasycznym. W rywalizacji pucharowej Bauer po raz drugi w karierze wygrał Tour de Ski, wygrywając dwa ostatnie etapy: 20 km klasykiem w Val di Fiemme i podbieg 10 km stylem dowolnym na Alpe Cermis. W klasyfikacji końcowej o ponad minutę wyprzedził Northuga i Colognę. W pozostałych zawodach Pucharu Świata na podium stanął trzy razy: 16 stycznia w Otepää wygrał bieg na 15 km klasykiem, 6 marca w Lahti był drugi w biegu łączonym na 30 km, a 20 marca w Falun był trzeci w biegu łączonym. W klasyfikacji generalnej wyniki te dały mu drugie miejsce za Northugiem, drugi był też w klasyfikacji dystansowej. Zdobył także mistrzostwo Czech w biegu na 15 km stylem klasycznym.