Za kluczowego rywala dla Lincolna obrano również utworzonego przez Henry’ego Lelanda Cadillaca, który ostatecznie stał się podległy konkurencyjnemu koncernowi General Motors.
W 1939 roku miał miejsce początek najpopularniejszej i najdłużej obecnej na rynku linii modelowej o nazwie Continental, obecną na rynku kolejno w latach 1939–1948, 1960–2002 oraz 2016–2020. Limuzyny Continental pełniły też funkcję limuzyn prezydenckich, na czele z Johnem F. Kennedym. Po wykupieniu przez Forda, Lincoln utracił status samodzielnego przedsiębiorstwa i stał się oddziałem koncernu Forda. W 1945 roku połączono go z oddziałem Mercury, tworząc oddział Lincoln-Mercury. W 1958 roku dołączono jeszcze krótko istniejącą markę Edsel, tworząc przejściowo oddział Mercury-Edsel-Lincoln (MEL).
Na przełomie lat 80. i 90. XX wieku Lincoln przedstawił drugą generację topowego, luksusowego modelu Town Car, która razem z kolejną generacją z 1997-2011 przysporzyła przedsiębiorstwu międzynarodowej rozpoznawalności i popularności dzięki częstym modyfikacjom jako wydłużona limuzyna używana np. przez przemysł ślubny.