Jego niekonwencjonalne metody pracy zazwyczaj nie wzbudzają zakłopotania wśród szeryfa Trumana i jego podwładnych.

Niezależnie od Coopera swoje śledztwa w sprawie śmierci Palmer samodzielnie prowadzą: James, Donna (Lara Flynn Boyle) i Audrey (Sherilyn Fenn).

W snach Coopera pojawiają się dwie postaci: MIKE (Al Strobel) i BOB (Frank Silva). BOB jest jedną z najbardziej tajemniczych postaci serialu. Według jednej z interpretacji jest on duchem, potrafiącym przejmować kontrolę nad człowiekiem. Do istnienia miałby potrzebować emocji, które wzbudzają kontrolowane przez niego osoby dokonujące przemocy. BOB jest opisywany również jako wytwór wyobraźni Laury lub jej ojca Lelanda (Ray Wise), a także alter ego Lelanda. Ponadto Cooper trafia do zagadkowego Czerwonego Pokoju, gdzie znajdują się roztańczony karzeł (Michael J. Anderson), MIKE i sobowtór Laury Palmer. Czerwony Pokój składa się z kafelkowej podłogi w czarno-białym wzorze, kilku mebli, lamp podłogowych, reprodukcji Wenus z Milo i czerwonych zasłon, rozciągających się od podłogi do nigdy nie pokazanego sufitu Jednoręki MIKE recytuje niezrozumiały wiersz, karzeł wypowiada bełkotliwe słowa oraz nieskoordynowanie porusza się po Czerwonym Pokoju, a sobowtór Palmer szepcze Cooperowi imię mordercy.