Organizacja Dowództwo Dowódca NORAD-u jest wyznaczany przez prezydenta USA i premiera Kanady. Jego sztab znajduje się w Peterson Air Force Base, a najbliższe centrum kontroli i dowodzenia jest w Cheyenne Mountain Air Station. W górze Cheyenne znajduje się także centrum dowodzenia amerykańskiego globalnego systemu obrony antyrakietowej.
28 lipca 2006 roku kierując się względami logistycznymi jak i z uwagi na ustanie zagrożenia atakiem rakietowym Dowództwo przeniesiono do Peterson Air Force Base. Ośrodek w Cheyenne jest jednak wciąż utrzymywany i w razie takiej konieczności może przyjąć ponownie dowództwo NORAD.
Dowódcy Donald Kutyna, Siły Powietrzne Stanów Zjednoczonych (1990 – 1992) Joseph Ashy, Siły Powietrzne Stanów Zjednoczonych (1994 – sierpień 1996) Howell Estes, Siły Powietrzne Stanów Zjednoczonych (sierpień 1996 – 14 sierpnia 1998) Richard Myers, Siły Powietrzne Stanów Zjednoczonych (14 sierpnia 1998 – 22 lutego 2000) Ralph E. „Ed” Eberhart, Siły Powietrzne Stanów Zjednoczonych (22 lutego 2000 – 5 listopada 2004) Timothy Keating, Marynarka Wojenna Stanów Zjednoczonych (5 listopada 2004 – 23 marca 2007) Victor E.