Wydania Seria ukazuje się nieregularnie w formie zeszytów w kilkutygodniowych lub kilkumiesięcznych odstępach. Zeszyty zbierane są następnie w tomy zbiorcze. Wydawcami oryginału amerykańskiego są: Fantagraphic Books (tomy 1–7), Dark Horse Comics (tomy 8–33) i IDW Publishing (od tomu 34.). Polskimi wydawcami serii są: Mandragora (tomy 1–7) i Egmont Polska (od tomu 8. oraz wznowienia wcześniejszych tomów). W 2020 roku Egmont wydał wznowienie tomów w formie zbiorczej, zaczynając od tomu Usagi Yojimbo: Początek, gdzie na pierwszy tom składały się nr 1 - 4.
Spis tomów Główna seria NrTytuł i rok pierwszego wydania polskiegoTytuł i rok wydania oryginalnego1Ronin (2003)The Ronin (1987)2Samuraj (2004)Samurai (1989)3Droga wędrowca (2004)The Wanderer's Road (1989)4Spisek ryczącego smoka (2004)The Dragon Bellow Conspiracy (1990)5Samotny cap i koźlę (2005)Lone Goat and Kid (1992)6Kręgi (2005)Circles (1994)7Gen (2005)Gen's Story (1996)8Cienie śmierci (2002)Shades of Death (1997)9Daisho (2002)Daisho (1998)10Pomiędzy życiem a śmiercią (2002)The Brink of Life and Death (1998)11Pory roku (2003)Seasons (1999)12Ostrze bogów (2003)Grasscutter (1999)13Szare cienie (2003)Grey Shadows (2000)14Maska demona (2004)Demon Mask (2001)15Ostrze bogów II.