Załoga przez 4 tygodnie pracowała na pokładzie stacji Salut 4. marzec 1976 – rozpoczął przygotowania, jako dowódca podstawowej załogi odwiedzającej (lot krótkotrwały), do lotu na stację kosmiczną Salut 6. grudzień 1976 został włączony do międzynarodowej załogi razem z Vladimírem Remkiem (Czechosłowacja). 2–10 marca 1978 – po raz drugi poleciał w kosmos razem Vladimírem Remkiem na statku kosmicznym Sojuz 28. Była to pierwsza międzynarodowa załoga programu Interkosmos. 1 września 1981 – rozkazem dowództwa lotnictwa, z uwagi na stan zdrowia, Gubariew został zwolniony z oddziału kosmonautów.
Loty załogowe „Sojuz 17” 10 stycznia 1975 statek kosmiczny Sojuz 17 wystartował z kosmodromu Bajkonur w kierunku stacji kosmicznej Salut 4. Na jego pokładzie była dwuosobowa załoga: dowódca Aleksiej Gubariew oraz inżynier pokładowy Gieorgij Grieczko. Dwa dni później, 12 stycznia kosmonauci przycumowali do Saluta 4 i przeszli na jego pokład. Byli pierwszą stałą załogą tej stacji. Głównym zadaniem kosmonautów poza przetestowaniem systemów nowej stacji było przeprowadzenie badań astrofizycznych, dlatego też oba pojazdy znalazły się na wysokiej ponad 350 km orbicie. Załoga przeprowadziła również całą serię eksperymentów z dziedziny astronomii, w tym obserwacje Słońca, Ziemi i innych planet.