Phillip E. Johnson (ur. 18 czerwca 1940 w Aurora, w stanie Illinois, zm. 2 listopada 2019 w Berkeley) – amerykański profesor prawa na uniwersytecie Berkeley w Kalifornii.
Phillip E. Johnson jest jedną z głównych postaci zaangażowanych w koncepcję inteligentnego projektu, jest autorem książki Sąd nad Darwinem (ang. Darwin on Trial) zawierającej krytykę darwinizmu oraz inicjatorem tzw. strategii klina (wedge strategy), społecznej akcji zapoczątkowanej przez Discovery Institute, organizację grupującą krytyków ewolucjonizmu i promującą wspomnianą teorię inteligentnego projektu. Twierdzi że akceptacja metafizycznego naturalizmu w nauce czyni z niej metafizyczną opowieść o tym jak powstał światWielka metafizyczna opowieść nauki.
Znany jest również z promowania z Kary B. Mullisem oraz Charlesem Thomasem opinii, wygłaszanej mimo sprzeciwów wspólnoty naukowej, że wirus HIV nie jest przyczyną AIDS, ponieważ istnieją osoby o symptomach AIDS bez zarażenia wirusem HIV oraz nosiciele tego wirusa bez widocznych symptomów AIDS – Reason, June 1994.
Życiorys Johnson otrzymał stopień bakałarza z angielskiej literatury na Uniwersytecie Harvarda oraz ukończył studia prawnicze na Uniwersytecie w Chicago.