Został pochowany na cmentarzu Langata. 9 sierpnia 2023 r. odbył się ponowny pogrzeb Sapiehy. Jego doczesne szczątki zostały ekshumowane i przetransportowane do Polski, a następnie pochowane w kaplicy św. Judy Tadeusza kościoła w Boćkach. mały|Tablica Eustachego Kajetana Sapiehy w kościele w Boćkach
Życie prywatne Był ojcem Jana Andrzeja, Lwa Jerzego, Eustachego Seweryna i Elżbiety.
Ordery i odznaczenia W 1955 i 1959 był wyznaczany przez Augusta Zaleskiego na następcę prezydenta RP. Postanowieniem z 7 sierpnia 1959 r. został przez prezydenta RP Augusta Zaleskiego odznaczony Orderem Orła Białego. Był też m.in. kawalerem Krzyża Wielkiego Orderu Narodowego Legii Honorowej i Orderu Gwiazdy RumuniiMarta Męclewska (oprac.): Kawalerowie i statuty Orderu Orła Białego 1705–2008. Zamek Królewski w Warszawie, 2008, s. 308.Anna Amanowicz: Historyk rodu, promemoria.pl..
Upamiętnienie mały|Tablica upamiętniająca Eustachego Sapiehę w Fort Jesus w Mombasie 16 listopada 2022 r.