Modernizacje powojenne (1947–1980) Po zniszczeniach wojennych odbudowano spalone obiekty zaplecza (poczta, magazyny) w uproszczonej formie. W latach 60.–80. prowadzono etapowe modernizacje torów i peronów, przygotowując teren pod przyszłe Krakowskie Centrum Komunikacyjne, jednak kryzys gospodarczy spowolnił inwestycje.
Modernizacja Na początku XXI wieku przeprowadzono kompleksową modernizację węzła kolejowego w Krakowie, obejmującą wymianę torów, sieci trakcyjnej, urządzeń sterowania ruchem, budowę nowych peronów oraz realizację podziemnej hali dworca, a zlokalizowano także stanowiska taksówek.
Po 2014 r. teren wokół Dworca Głównego przekształcano z myślą o budowie dzielnicy usługowo-biznesowej określanej jako Nowe Miasto, planowanej pierwotnie przez Tishman Speyer Properties. Projekt szacowany na ok. 700 mln dolarów, obejmujący około 20 ha wzdłuż ul. Pawiej, nie został zrealizowany z powodu trudności z pozyskaniem terenów. W kolejnych latach obszar zabudowano głównie funkcjami komercyjnymi (handel, hotele, biurowce), bez założonych wcześniej głównych placów i przestrzeni publicznych.