Zbigniew Małkowski (ur. 19 stycznia 1978 w Olsztynie) – polski piłkarz występujący na pozycji bramkarza, trener, ostatnio szkoleniowiec bramkarzy.
Kariera piłkarska Był wychowankiem Warmii Olsztyn, następnie bronił barw Stomilu Olsztyn. 7 marca 1998 zadebiutował w I lidze w przegranym 1:2 meczu z Ruchem Chorzów. W sezonie 1999/2000 był podstawowym graczem swojego klubu – zagrał w 26 spotkaniach. W 2000 przeszedł do Feyenoordu Rotterdam, w którym nie wywalczył miejsca w podstawowym składzie. W latach 2001–2003 wypożyczony był do SBV Excelsior, z którym w 2002 awansował do Eredivisie. W holenderskiej ekstraklasie po raz pierwszy wystąpił 17 sierpnia w przegranym 0:2 pojedynku z PSV Eindhoven.
W 2005 podpisał dwuletni kontrakt z Hibernian FC. W lidze szkockiej zadebiutował 30 lipca w zremisowanym 1:1 meczu z Dunfermline Athletic. Przez następne półtora roku był podstawowym bramkarzem swojego klubu. W marcu 2007 został wypożyczony do Gretny FC. W pierwszym spotkaniu w jej barwach obronił rzut karny. W sezonie 2007/08 przebywał na wypożyczeniu w Inverness Caledonian Thistle.
Wiosną 2009 był zawodnikiem OKS 1945 Olsztyn, w którym pełnił także funkcję trenera bramkarzy. W lipcu rozwiązał kontrakt z olsztyńskim klubem.