Do Krakowa Czuchajowski powrócił w listopadzie i natychmiast złożył sprawozdanie oraz rozliczył się z pobranych pieniędzy rządzącemu Krakowem Ernestowi Zörnerowi. Został na krótko aresztowany, następnie zwolniony z zakazem opuszczania miasta. Ponownie aresztowany 8 maja 1941 i mimo poważnej choroby serca wysłany do niemieckiego obozu koncentracyjnego Auschwitz, gdzie wkrótce został rozstrzelany.
W czerwcu 2009 został patronem ulicy w Krakowie.
Ordery i odznaczenia Krzyż Niepodległości – 6 czerwca 1931 „za pracę w dziele odzyskania niepodległości”.
Przypisy
Bibliografia Marek Lovell, Pałac Wielopolskich i jego lokatorzy, cz. 12, Dziennik Polski z dnia 19 grudnia 1998 r. Encyklopedia Krakowa, PWN Kraków 2000. Bolesław Czuchajowski, Wykaz Legionistów Polskich 1914-1918, Muzeum Józefa Piłsudskiego w Sulejówki .