W stolicy Egiptu doszło do zamieszek, a opiekę nad królewskimi dziećmi przejęli dwaj mężowie stanu, Kineas i Komanos. Szybko zawrócili z morza Filometora. Naprędce utworzono specjalną radę w Aleksandrii, która zdecydowała się wysłać posłów do Antiocha. Mieli nimi być przedstawiciele Związku Achajskiego i Aten oraz Klazomenaj i Miletu. Antioch przyjął ich i wysłuchał. Stanowczo potwierdził swoje prawa do Celesyrii i osobiście spotkał się z Ptolemeuszem VI, którego zdradziła straż przyboczna. Przekonał go do swych racji i zawarł z nim porozumienie. Tymczasem w Aleksandrii wybuchły zamieszki, a współrządcami ogłoszono Kleopatrę i jej młodszego brata Ptolemeusza VIII. Dla Antiocha była to bardzo dobra sytuacja, gdyż liczył na wybuch wojny domowej w Egipcie. Wystąpił wtedy jako obrońca praw Ptolemeusza VI. Ponieważ w marszu na Egipt opanował Memfis to pozostawił tam chłopca jako króla. Zaczął oblegać stolicę. Gdy trwało to już dostatecznie długo do miasta przybyli posłowie z Rodos na polecenie konsula Marcjusza Filipa, dowódcy wojsk rzymskich w Macedonii. Aleksandryjczycy wysłali ich do Antiocha, który oświadczył, że Egipt należy się starszemu Ptolemeuszowi. Z nim doszedł do porozumienia i jeśli oni przyjmą go z powrotem, to nie będzie w tym przeszkadzał.