W 2010 roku Reuters ujawnił korespondencję urzędników Komisji, którzy ukrywali lub przeinaczali wyniki badań naukowych dla wsparcia politycznego programu promocji biopaliw. Wkrótce potem Komisja została pozwana do sądu przez organizację ClientEarth z zarzutem ograniczania prawa do informacji publicznej. Kontrowersje wzbudza także – zgodna z przepisami KE – praktyka wypłacania byłym komisarzom „przejściowych wynagrodzeń” w wysokości 40–65% ich zarobków przez trzy lata od odejścia z pracy.
Obecny skład Komisji
KomisarzStanowiskoPartiaPaństwo członkowskieCzas pełnienia stanowiskaPrzypisy Od Do przewodnicząca Komisji Europejskiej Europejska Partia Ludowa Niemcy komisarz ds. wewnętrznych i migracji Europejska Partia Ludowa Austria komisarz ds. gotowości i zarządzania kryzysowego oraz równości Odnówmy Europę Belgia komisarz ds. start-upów, badań naukowych i innowacjiEuropejska Partia Ludowa Bułgaria komisarz ds. Morza Śródziemnego Europejska Partia Ludowa Chorwacja komisarz ds. rybołówstwa i oceanów Europejska Partia Ludowa Cypr komisarz ds. partnerstwa międzynarodowego Europejska Partia Ludowa Czechy komisarz ds. energii i mieszkalnictwaPartia Europejskich Socjalistów Dania wiceprzewodnicząca, wysoki przedstawiciel Unii do spraw zagranicznych i polityki bezpieczeństwa Odnówmy Europę Estonia wiceprzewodnicząca wykonawcza ds.