W latach 1991–2016 pełnił funkcję dyrektora Instytutu Stosunków Międzynarodowych (został wybrany 8 razy w bezpośrednich wyborach przez pracowników Instytutu). Kierował także Zakładem Ekonomii Politycznej Stosunków Międzynarodowych ISM. Po rozwiązaniu ISM w 2019, Edward Haliżak był pracownikiem Katedry Studiów Regionalnych i Globalnych WNPiSMStrona Wydziału Nauk Politycznych i Studiów Międzynarodowych Uniwersytetu Warszawskiego https://wnpism.uw.edu.pl/. Od 2020 pracownik emerytowany Uniwersytetu Warszawskiego.
Od uzyskania dyplomu magisterskiego był związany zawodowo z Instytutem Stosunków Międzynarodowych, gdzie pracował na stanowiskach asystenta-stażysty, adiunkta, profesora UW i profesora zwyczajnego. Od 1982 pełnił funkcję wicedyrektora Instytutu, a w latach 1990–2016 zajmował stanowisko dyrektora Instytutu.
W 2011 został członkiem Komitetu Nauk Politycznych Polskiej Akademii Nauk. Objął także przewodnictwo Polskiego Towarzystwa Studiów MiędzynarodowychKRS . Zaangażowany w utworzenie międzynarodowych stowarzyszeń naukowych, m.in. (1993–1996).
Od 1990 wypromował 190 magistrów stosunków międzynarodowych oraz 30 doktorów, m.in. Jakuba Zajączkowskiego.
Profesor E.M.