Góra twierdził, że:

Ponadto niektórzy katolicy oskarżali Górę o tworzenie sekty, otaczanie się młodymi kobietami i stanowienie zagrożenia dla innych.

Upamiętnienie mały|Tablica upamiętniająca Jana Górę na kościele św. Michała Archanioła w Prudniku mały|Skwer Jana Góry w Poznaniu W 2016 premierę miała książka „Zapisane kartki Ojca Jana Góry. Antologia”, będąca zbiorem tekstów o. Jana Góry, wybranych przez Wojciecha Wiśniewskiego. Każdy rozdział autor poprzedził komentarzem, który przybliżał czytelnikom postać o. Góry.

Od 3 września 2016 Jan Góra jest patronem jednej z ulic w Lucinach koło Śremu.

W lutym 2017 Krzysztof Krawczyk, przyjaciel Jana Góry, wydał album pt. Psalmy Dawidowe. Pamięci o. Jana Góry OP, zawierający niepublikowane dotąd na jednej płycie utwory, które powstały w ciągu kilkudziesięciu lat jako owoc poszukiwań i duchowej przemiany artysty po tragicznych wydarzeniach, jakie miały miejsce w jego życiu. Do zrealizowania tego pomysłu zachęcił go Jan Góra podczas ich pierwszego spotkania. Na płycie znalazł się hymn „Abba Ojcze”, którego autorem był Jan Góra.

Co roku od 2017 w sierpniu odbywają się Dni Jana Góry na Jamnej.