pod koniec listopada 1916 klub wraz z Komendą Legionów przeniósł się do Warszawy. Pierwszy mecz, w którym rywalem była Polonia Warszawa, odbył się 29 kwietnia 1917 roku na Agrykoli i zakończył remisem 1:1. W lipcu 1917 odbyło się zebranie wszystkich członków klubu, na którym podsumowano dotychczasową działalność; wybrano wtedy nowego kapitana zespołu (którym został Stanisław Wykręt), a także nowego prezesa – por. Norberta Okołowicza. Łącznie z dziewięciu rozegranych w Warszawie spotkań Legia wygrała sześć, a trzy zremisowała. W pierwszym wyjazdowym spotkaniu drużyna odniosła zwycięstwo 2:1 nad Cracovią (ówczesnym mistrzem Polski) w Krakowie, wobec czego została nieoficjalnym mistrzem kraju. Zespół ostatecznie rozpadł się w wyniku tzw. kryzysu przysięgowego.
Lata 20. i 30. XX wieku thumb|Tłumy na stadionie Legii Warszawa po zakończonym meczu. Okres międzywojenny 14 marca 1920 w Warszawie powstał nowy klub sportowy z przeznaczeniem dla żołnierzy. W salach kasyna oficerskiego w Zamku Królewskim grupa oficerów utworzyła Wojskowy Klub Sportowy (WKS) Warszawa, ustalając dla niego biało-czerwone barwy statutowe. Wśród nich był Zygmunt Wasserab, jeden z założycieli Legii w czasach legionowych. Pomimo jego obecności, WKS początkowo w żaden sposób nie nawiązywał do „Drużyny Sportowej Legia”.