Kościół św. Jana Chrzciciela – rzymskokatolicki kościół parafialny znajdujący się w Krakowie na Prądniku Czerwonym. Kościół zbudowany jest w pobliżu zabytkowej kaplicy św. Jana Chrzciciela.
Historia Początkowo nabożeństwa były odprawiane w zabytkowej kaplicy a następnie pod prowizorycznym zadaszeniem obok niej. 24 lutego 1981 roku uzyskano wstępne zezwolenie na budowę nowej świątyni. Po erygowaniu nowej parafii pw. św. Jana Chrzciciela uzyskała ona 17 grudnia 1982 roku decyzję lokalizacji kościoła i sal katechetycznych na terenie 1,7 ha. terenów dawnego folwarku dominikańskiego.
1 czerwca 1983 roku kardynał Franciszek Macharski poświęcił plac przyszłej budowy, a 19 grudnia tego roku wydano prawomocne pozwolenie na budowę kościoła. Projekt świątyni na planie kwadratu opracowali Wojciech Obtułowicz i Danuta Olędzka. Prace budowlane rozpoczęto 5 kwietnia następnego roku, trwały one do 2 grudnia 1989, kiedy uroczyście poświęcono mury nowego kościoła.
Konsekracja ołtarza przez kardynała Franciszka Macharskiego miała miejsce 16 grudnia 1994 roku, natomiast konsekracja całej świątyni nastąpiła 16 grudnia 2000 roku.