Poprzez pogarszający się stan instrumentu konieczna była budowa nowych organów. Prace powierzono firmie Paula Voelknera z Bydgoszczy. Jest to największy zachowany instrument tego budowniczego na świecie i jedyny z trzema manuałami. W chwili wykonania organy miały 52 głosy. Do budowy wykorzystano dawny prospekt z organów Sauera. Przebudową organów zajął się J. Goebl z Gdańska, lecz prawdopodobnie jej nie ukończył. Po II wojnie światowej Robert Polcyn dokonał częściowej rekonstrukcji instrumentu i doprowadził go do stanu używalności.
Organy po 2000 roku przeszły generalny remont przeprowadzony przez organmistrza Jana Drozdowicza z Poznania.
Dyspozycja instrumentu: Manuał IManuał IIManuał IIIPedał1. Prinzipal 16'1. Geigenprinzipal 8'1. Bordun 16'1. Prinzipalbass 16'2. Prinzipal 8'2. Salizional 8'2. Ital. Prinzipal 8'2. Subbass 16'3. Dulziana 8'3. Quintaton 8'3. Gamba 8'3. Echobass 16'4. Gemshorn 8'4. Gedackfloete 8'4. Vox coelestis 8'4. Quintbass 10 2/3'5. Floete harm. 8'5. Gamba 4'5. Konzertfloete 8'5. Oktavbass 8'6. Gedackt 8'6. Fugara 4'6. Rohrfloete 8'6. Bassfloete 8'7. Oktave 4'7. Gedackt 4'7. Floete harm. 4'7. Oktave 4'8. Rohrfloete 4'8. Octave 2'8. Oktave 4'8. Floete 2'9. Quinte 2 2/3'9. Quinte 1 1/3'9. Nasat 2 2/3'9. Trompete 8'10. Prinzipal 2'10. Nachthorn 1'10. Piccolo 2'10. Pozaune 16'11. Kornet 3-f11.