Nelson Rafael Cuevas Amarilla (ur. 10 stycznia 1980 w Asunción) – paragwajski piłkarz występujący najczęściej na pozycji prawego skrzydłowego, reprezentant Paragwaju. Obdarzony przydomkiem „Pipino”.
Kariera klubowa Cuevas rozpoczynał swoją karierę piłkarską w ojczyźnie, skąd w 1998 wyjechał do River Plate aby występować w argentyńskiej Primera División, gdzie w 1998 roku był mistrzem Apertury, w 2002 Clausury, zaś w 2000 zarówno Apertury, jak i Clausury. W 2003 grał krótko w zespole z Szanghaju, z którym zdobył wicemistrzostwo Chin i powrócił do Argentyny, gdzie wywalczył tytuł w Torneo Clausura 2004. W 2005 został sprzedany do Club América, który to szybko wypożyczył go do innego zespołu ligi meksykańskiej, C.F. Pachuca, z którym Cuevas wywalczył mistrzostwo kraju w 2006. Od 2006 do końca 2007 roku występował w Américe. W 2008 roku wrócił do Paragwaju i został zawodnikiem Club Libertad. Jednak rok ten kończył jako piłkarz brazylijskiego Santosu FC. W 2009 roku przeszedł do Universidad de Chile. Później występował także w paragwajskiej Olimpii, hiszpańskim drugoligowcu Albacete Balompié, meksykańskiej Puebli oraz Cerro Porteño.