Administrare, Dziennikarskie Koło Naukowe, Koło Filmowe POWIĘKSZENIE, Koło Naukowe Psychokryminologii „Kryptonim”, Koło Naukowe HEADLINE, Koło Naukowe VIRIDIS Uczelnia posiada: Bibliotekę Wydawnictwo Naukowe Akademii Ignatianum w Krakowie Międzywydziałowe Studium Języków Obcych Fundację Ignatianum Fundację św. Ignacego Loyoli Ignacjańskie Centrum Wolontariatu Biuro Współpracy Międzynarodowej Centrum Obsługi Studenta (w ramach tej jednostki funkcjonuje Biuro Rekrutacji) Biuro ds. Osób Niepełnosprawnych Biuro Promocji Akademickie Biuro Karier Poradnię Psychologiczno-Pedagogiczną Centrum Ochrony Dziecka Centrum Kultury i Dialogu Chór Akademicki
Wydział Filozoficzny Uniwersytet Ignatianum w Krakowie oferuje program filozofii na poziomie licencjackim, magisterskim i doktoranckim. Jako uczelnia jezuicka korzysta z dorobku pedagogiki Ignacjańskiej, z jezuickiego zaangażowania na rzecz promowania sprawiedliwości społecznej, dialogu ekumenicznego, międzyreligijnego i międzykulturowego, ale też rozbudowuje program w kierunku pogłębienia refleksji w dziedzinie zarządzania, coachingu, komunikacji społecznej i mass mediów oraz różnych specjalistycznych