Niewiele brakowało, by z powodu aroganckiego zachowania Doherty reżyser William Friedkin zrezygnował z niej podczas kręcenia dramatu Showtime Ciupołamacze (Jailbreakers, 1994) z Antonio Sabato Jr., jednak aktorka ostatecznie zagrała w filmie główną rolę. Potem pojawiła się w telewizyjnym dreszczowcu erotycznym Pokusa (Blindfold: Acts of Obsession, 1994) z Juddem Nelsonem i Michaelem Woodsem, horrorze Na pograniczu śmierci (Almost Dead, 1994) oraz jako Rene Mosier w komedii Kevina Smitha Szczury z supermarketu (Mallrats, 1995).
Wciąż grała przede wszystkim w filmach telewizyjnych, w tym w biografii CBS Robert Kennedy i jego czasy (Robert Kennedy and His Times, 1985) wcieliła się w Kathleen Kennedy, sensacyjnym Loteria śmierci (The Ticket, 1997) z Jamesem Marshallem, dramacie NBC Jacka Bendera Przyjaciele do końca (Friends 'Til the End, 1997) jako Heather Romley, dreszczowcu CBS Sypiając z diabłem (Sleeping with the Devil, 1997) z Timem Mathesonem i Bonnie Bartlett jako pielęgniarka Rebecca Dubrovich, córka polskich emigrantów.
W 1998 po raz kolejny pojawiła się w produkcji Aarona Spellinga, gdy zaproponowano jej rolę Prue Halliwell w serialu Czarodziejki.