Był to najlepiej sprzedający się samochód hybrydowy w Polsce po Toyocie Auris, a przed Toyotą Prius.
W lipcu 2014 roku auto przeszło największy w swojej historii lifting, obejmujący ponad 1000 nowych części. Zmieniono m.in. przód pojazdu z charakterystycznym dla nowych modeli marki grillem w kształcie litery „X” oraz reflektory ze zintegrowanymi światłami do jazdy dziennej wykonanymi w technologii LED. Z tyłu przeprojektowano reflektory i zderzak. Zmodyfikowano też platformę i zawieszenie, wyciszono wnętrze, dodano nowy 7-calowy system multimedialny Toyota Touch II i nowe wersje kolorystyczne nadwozia i wnętrza. Równocześnie została wprowadzona wersja hybrydowa.
Na początku 2017 roku zaprezentowano trzecie wcielenie Toyoty Yaris po drugim liftingu. Tym razem zmiany objęły już głównie kwestie stylistyczne – po raz pierwszy w swojej historii model otrzymał dwuczęściowe tylne światła. Z przodu z kolei grill stał się jednoczęściowy i obejmuje teraz jeszcze większą powierzchnię.