Kościół św. Franciszka Salezego – zabytkowy kościół rzymskokatolicki i klasztor wizytek znajdujący się w Krakowie, w dzielnicy I Stare Miasto przy ul. Krowoderskiej 16, na rogu z ulicą Biskupią, na Piasku.
Budowę rozpoczęto w 1692, po tym, jak biskup krakowski Jan Małachowski sprowadził do Krakowa zakon wizytek w 1681. W 1695 budowę na podstawie planów Jana Solariego zakończono. Kościół odnawiał w latach 1875–1876 Tomasz Pryliński.
Fasada kościoła jest bezwieżowa i zwieńczona trójkątnym szczytem. Nawa nakryta sklepieniem kolebkowym na gurtach.
Do dziś zachowało się bogate barokowe wnętrze z malowidłami ukazującymi sceny z życia św. Franciszka Salezego i Joanny de Chantal (założycielki Wizytek), a w skarbcu także wiele tkanin i szat liturgicznych z XVIII wieku. W kościele znajduje się cudowny obraz Matki Boskiej Nieustającej Pomocy koronowany koronami papieskimi w 1929. Tutaj święcenia kapłańskie przyjął późniejszy prymas Polski August Hlond. W ogrodzie ponadto znajdują się barokowe kaplice, m.in. drewniana kaplica z Kalwarią. Na ścianie klasztoru znajduje się zegar słoneczny, na którym widnieje napis Życie sen krótki.
thumb|center|300px|Wnętrze kościoła
W chórze zakonnym znajduje się serce biskupa fundatora Jana Małachowskiego.
Od 1977 do 2017 roku rektorem kościoła znany był duszpasterz, ks. Mieczysław Maliński.