W 1602 roku miasto zostało niespodziewanie zaatakowane i zdobyte przez wojska cara moskiewskiego Borysa Godunowa.
Po powstaniu Chmielnickiego i wojnie z Moskwą, Pryłuki zostały utracone przez Polskę wraz z Ukrainą Lewobrzeżną w 1686 w pokoju Grzymułtowskiego na rzecz Rosji.
W 1881 urodził się tutaj Feliks Bołsunowski – polski dowódca wojskowy, pułkownik pilot i obserwator balonowy Wojska Polskiego II RP.
W dniu 2 października 1920 roku żołnierze Armii Konnej Budionnego zamordowali w mieście 21 Żydów, a 12 ranili.
Od 1922 do 1991 część ZSRR, w latach 1941–1943 pod okupacją niemiecką.
Podczas okupacji hitlerowskiej, 1 stycznia 1941 roku Niemcy utworzyli getto dla żydowskich mieszkańców. Przebywało w nim około 1500 osób. 20 maja 1942 roku Niemcy zlikwidowali getto, a Żydów zamordowali w okolicy miasta. Sprawcą zbrodni było SD- Sonderkommando Plath (dowódca SSHauptsturmführer Karl Julius Plath), niemiecka żandarmeria i lokalna ukraińska policja.
W 1989 liczyła 71 954 mieszkańcówВсесоюзная перепись населения 1989 г.