Był autorem wielu dzieł z dziedziny historii, biologii oraz geografii. Zapisał się w historii polskiej turystyki także jako jeden z pierwszych autorów nowoczesnych przewodników turystycznych w języku polskim – m.in. należy tu wydany 1860 w Krakowie nakładem Juliusza Wildta Przewodnik w wycieczkach na Babią Górę, do Tatr i Pienin, jak również Bardyjów. Historyczno-topograficzny opis miasta i okolicy, przedrukowany z oryginału jeszcze w roku 1991. Napisał następujące dzieła:
Historyczno-topograficzna wiadomość o wodach lekarskich bardyowskich, 1858Eugeniusz Janota, „Historyczno-topograficzna wiadomość o wodach lekarskich bardyowskich”, Kraków 1858. Wiadomość historyczna i jeograficzna o Żywieccczyźnie, 1859Eugeniusz Janota, „Wiadomość historyczna i jeograficzna o Żywieccczyźnie”, Gwiazdka Cieszyńska, Cieszyn 1859. Przewodnik w wycieczkach na Babią Górę, do Tatr i Pienin, 1860 Bardyjów. Historyczno-topograficzny opis miasta i okolicyEugeniusz Janota, „Bardyjów. Historyczno-topograficzny opis miasta i okolicy”, Rocz. Tow.