Negocjacje nad utworzeniem organizacji toczyły się od wiosny do września 1940 r. Ich inicjatorami byli: Jan Włodarkiewicz, Witold Rościszewski i Bolesław Piasecki. Ostatecznie za datę powstania Konfederacji Narodu przyjmuje się 28 września (lub 19 września) 1940 r. 7 października przyjęta została deklaracja ideowa i statut. W grudniu opracowano instrukcję organizacji struktury terytorialnej.
W skład Konfederacji Narodu weszły:
Tajna Armia Polska „Znak” „Pobudka” „Wawel” Związek Czynu Zbrojnego Gwardia Obrony Narodowej
Struktura organizacyjna Na czele KN stanął Tymczasowy Związek Rady KN, do którego weszli z ramienia poszczególnych organizacji:
mjr Jan Włodarkiewicz (ps. „Jan Darwicz”) – Tajna Armia Polska Stanisław Dangel (ps. „Salisch”) – „Znak” ppłk Julian Znamierowski (ps. „Profesor Witold”) – Związek Czynu Zbrojnego mjr Józef Pater (ps. „Orlot”) – Gwardia Obrony Narodowej
W grudniu TZR KN przyjął nazwę Prezydium Konfederacji Narodu. Funkcję jego przewodniczących pełnili:
ppłk Julian Znamierowski (ps. „Profesor Witold”) – 4–28 stycznia 1941 r. mjr Jan Włodarkiewicz (ps. „Jan Darwicz”) – od 28 stycznia 1941 r.
Kapelanem organizacji, a także jednym ważniejszych jej ideologów, był ksiądz Józef Warszawski ps.