Spółki zależne pośrednio kontrolowane przez PKP Cargo CARGOSPEED BRANIEWO sp. z o.o. – kontrolowana w 100% – jeden z największych terminali przeładunkowych w rejonie Braniewa. Główne obszary działalności spółki stanowią przeładunki różnych towarów oraz handel węglem TRANSGAZ S.A. – kontrolowana w 63,97% spółka zajmuje się przeładunkiem gazów skroplonych oraz wyrobów petrochemicznych wymagających podgrzania (m.in. parafiny, wosków, niektórych olejów) PKP CARGO CONNECT GmbH – kontrolowana w 100% – międzynarodowy dostawca usług logistycznych, spółka zajmująca się transportem kolejowym, przeładunkami, magazynowaniem oraz obsługą celną PKP CARGO INTERNATIONAL HU Zrt – kontrolowana w 100% PKP CARGO INTERNATIONAL SI d.o.o. – kontrolowana w 80% PKP CARGO INTERNATIONAL AK, a.s. – kontrolowana w 100% AWT ROSCO a.s – kontrolowana w 100% AWT DLT s.r.o. – kontrolowana w 100% AWT CFT a.s. – kontrolowana w 100% AWT REKULTIVACE a.s – kontrolowana w 100%