Bez Gigana u jego boku, Megalon prawdopodobnie nie przetrwałby finałowej walki w filmie.
Historia Megalon był obrońcą podwodnego cesarstwa Seatopii i jego mieszkańcy czcili go jako bóg. Seatopianie rozgniewani na Ziemian z powierzchni Ziemi za testy nuklearne, które dotykają ich państwo, rozkazali Megalonowi zniszczyć ich wrogów. Został przebudzony ze snu i wyruszył ze swej pieczary na powierzchnię Ziemi.
Tam podążał za, stworzonym przez Gorō Ibukiego, robotem Jet Jaguarem sterowanego przez jednego z seatopskich agentów, by nakierować go na Tokio. W drodze zniszczył tamę, paradoksalnie ratując życie Ibukiemu i jego bratu Rokku-chanowi, którzy mieli zostać do niej zrzuceni w metalowej skrzyni przez niczego nieświadomych kierowców wywrotki.
Wkrótce Megalon wciąż prowadzony przez Jet Jaguara został zaatakowany przez wojska z Japońskich Sił Samoobrony, ale szybko je rozgromił. Kiedy Ibuki odzyskał kontrolę nad Jet Jaguarem i wysłał go do wezwania Godzilli, Megalon wpadł i zaczął bezmyślnie się wierzgać. Po zniszczeniu floty samolotów Megalon kontynuował swą wędrówkę, gdzie dokonał destrukcji Tokio.