Od 2001 roku, po udanym uzyskaniu nowej koncesji, rozgłośnia była zarządzana przez spółkę „Alex Media" powołaną przez Piotra Sambora w 2000 roku (od początku redaktora naczelnego stacji i prezesa wspomnianej spółki) i Radio 90 (dziś części spółki Multimedia powiązanej z Grupą RMF), jako mniejszościowego udziałowca (Piotr Sambor 36 udziałów Radio 90 4 udziały ). Spółka Radio 90, w niedługim czasie weszła w spory sądowe z Piotrem Samborem oraz Spółką Alex Media, gdyż Radio 90 miało inne plany odnośnie Radia Alex niż jego większościowy udziałowiec.
W 2005 roku udziały udziały Aleksandry i Piotra Samborów nabyła spółka Polamer Krystyny Rowińskiej. Piotr Sambor zachował funkcje Prezesa Zarządu i Redaktora Naczelnego Radia Alex, a do 16 grudnia 2021 roku zachowano tzw. status quo.
W grudniu 2021 roku sytuacja uległa zmianie, gdyż Piotr Sambor został odwołany ze stanowiska Prezesa Zarządu Spółki Alex Media 16 grudnia 2021 roku przez Nadzwyczajne Zgromadzenie Wspólników. W lutym 2022 roku ówczesny większościowy udziałowiec Spółki Alex Media, spółka Polamer Władysława Kotaby zmieniła lokalizację siedziby spółki Alex Media (z ulicy Smrekowej 26A na Bulwary Słowackiego 15B w Zakopanem a później siedzibę Redakcji na Krupówki 12 w Dworcu Tatrzańskim.