Zgodność oprogramowania Dzięki kompatybilności z dystrybucją Red Hat Enterprise Linux, wynikającej z wykorzystania tych samych źródeł oprogramowania, na komputerach z dystrybucją Scientific Linux możliwe jest instalowanie również komercyjnego oprogramowania, które zwykle funkcjonuje wyłącznie z dystrybucją firmy Red Hat.
Cele Scientific Linux został rozwinięty w różnych instytutach naukowych i na uniwersytetach z celem spełnienia wymogów stawianych przez użytkowników ze środowisk akademickich i badawczych, szczególnie nauk ścisłych. Najważniejsze aspekty to: dodatkowe elementy oprogramowania przydatne i wygodne w pracy naukowej otwarty system operacyjny (open source) wspólny podstawowy system operacyjny dla laboratoriów i naukowców odciążenie instytucji naukowych i laboratoriów od wysiłku budowania własnej dystrybucji Linuksa łatwe dopasowanie, aby np. laboratoria mogły rozprowadzać własną wersję dystrybucji z elementami własnymi, nie angażując się przy tym w budowanie wszystkiego od podstaw możliwość korzystania z komercyjnego oprogramowania przeznaczonego dla odpłatnego Red Hat Enterprise Linux mały|Poprzednie, animowane logo