W 1997 razem z J. Todd Harrisem założył studio producenckie Daly-Harris Productions. Wśród filmów wyprodukowanych przez Daly-Harris Productions znajdują się telefilmy Egzekucja sprawiedliwości (Execution of Justice, 1999), Urbania (2000) oraz Tick Tock (2000).
Daly został także właścicielem studia producenckiego Red House Entertainment, które założył z Amy Van Nostrand oraz przyjacielem Steve’em Burleighem. Wśród filmów wyprodukowanych przez studio znajdują się m.in. wyróżniony nagrodami Peabody i Humanitas Prize Mocne uderzenie (Edge of America) oraz jego debiut reżyserski Osierocona (Bereft).
Tim Daly wraz z byłą żoną założyli także Wandering Park Productions, poprzez które wyprodukowali obsypany nagrodami spektakl teatralny na podstawie sztuki Vincenta Cardinala A Colorado Catechism, w którym obydwoje wystąpili. Za swój występ w sztuce Daly i jego była żona w 1993 otrzymali nagrody DramaLogue dla najlepszego aktora dramatycznego i najlepszej aktorki dramatycznej.
Życie prywatne 18 września 1982 poślubił aktorkę Amy Van Nostrand. Mają dwoje dzieci: syna Sama (ur. 1984) i córkę Emelyn (ur. 1989). Jednak w 2010 roku doszło do rozwodu. W grudniu 2014 związał się z Téą Leoni, którą poznał na planie serialu Madam Secretary.