Idea zbawienia i odkupienia w religii Starego Testamentu, w 1937 roku uzyskał habilitację (rozprawa Zagadnienie cierpienia w religii i filozofii) i został docentem na Wydziale Teologii Ewangelickiej UWJ. Szturc, Niemczyk Wiktor ks., [w:] Tenże, Ewangelicy w Polsce. Słownik biograficzny XVI–XX w., Wydawnictwo Augustana, Bielsko-Biała 1998, s. 215 ..
Podczas okupacji niemieckiej został pozbawiony urzędu proboszcza i wysiedlony do Czernichowa.
W styczniu 1945 powrócił do Krakowa, by dalej służyć swemu zborowi. Pełnomocnik Rządu dla Dolnego Śląska powołał ks. Niemczyka na rzeczoznawcę do spraw kościelnych. Piastował urząd referenta do spraw Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w zarządzie miejskim Wrocławia. Był aktywny w organizacji życia kościelnego polskich ewangelików we Wrocławiu i na Dolnym Śląsku oraz przy odbudowie Uniwersytetu Wrocławskiego i Politechniki Wrocławskiej.