Od co najmniej 1458 roku Licheń miał prawa miejskie, jednak brak rozwoju oraz zniszczenia z czasów potopu szwedzkiego spowodowały ich utratę w roku 1655.
W 1579 roku na terenie Lichenia pracowało 4 rzemieślników i jeden szynkarz.
Od 1819 roku część majątku hrabiów Kwileckich.
W Licheniu znajduje się grobowiec kosynierów z 1863 roku, którzy 9 maja 1863 roku, pod dowództwem Michała Sokolnickiego, bronili się przed Rosjanami przy lokalnym cmentarzu. Zginęli wszyscy powstańcyTomasz Jankowski, W krwawym polu srebrne ptaszę, Wydawnictwo Ad Rem, Jelenia Góra 2023, s. 66, ISBN 978-83-67156-43-1..
12 września 1940 roku został zamordowany przez Niemców mieszkaniec Lichenia Szczepan Jankowiak. W miejscu egzekucji ustawiono w 1980 roku pamiątkowy głaz z tablicą.
W centrum wsi znajduje się kapliczka z wmurowanym monolitycznym krzyżem wykonanym z piaskowcaPiotr Maluśkiewicz, Województwo konińskie: szkic monograficzny, wyd. 1, Warszawa: Państwowe Wyd. Nauk, 1983, s. 222–223, ISBN 83-01-00534-3, OCLC 11783554..
Obecnie Licheń to jedno z większych sanktuariów maryjnych w Polsce (rocznie ok. 1,5 mln pielgrzymów i turystów), prowadzone przez księży marianów, przybyłych do tutejszej parafii w 1949 roku.