Na początku sezonu 2005/2006 Gavrančić doznał kontuzji, która wykluczyła go z gry na kilka miesięcy, toteż rozegrał tylko połowę meczów w sezonie, a jedynym sukcesem klubu było ponowne zdobycie krajowego pucharu. Sezon 2006/2007 Gavrančić rozpoczął już znów jako podstawowy obrońca drużyny i zdołał awansować z Dynamem po raz kolejny do fazy grupowej Ligi Mistrzów. W 2008 został wypożyczony do greckiego PAOK FC. Od 2009 bronił barw rodzimego Partizana Belgrad. We wrześniu 2010 ogłosił o zakończeniu kariery piłkarskiej w chińskim klubie Henan ConstructionGoran Gavrančić završio karijeru..
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1997/98 FK Čukarički Jugosławia Meridijan Superliga 6 0 1998/99 FK Čukarički Jugosławia Meridijan Superliga 12 0 1999/00 FK Čukarički Jugosławia Meridijan Superliga 23 0 2000/01 FK Čukarički Jugosławia Meridijan Superliga 16 1 2000/01 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 6 1 2001/02 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 17 4 2002/03 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 23 4 2003/04 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 28 6 2004/05 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 25 2 2005/06 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 15 4 2006/07 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 11 0 2007/08 Dynamo Kijów Ukraińska Wyszcza Liha 11 0 2007/08 PAOK FC Alpha Ethniki 7 0 2008/09 FK Partizan Meridijan Superliga 12 0 2009/10 FK