B-1 – niezrealizowany projekt wersji myśliwskiej, budowanej na podstawie wersji A-1. Miała mieć zmiany wspólne dla wersji B, ale pozostawione stare uzbrojenie. Nie ukończono ani jednego egzemplarza tej wersji, albowiem w trakcie budowy prototypów tej wersji zrezygnowano z jej rozwoju na rzecz wersji B-2 i B-3. B-2 – ciężki myśliwiec dzienny ze wzmocnionym uzbrojeniem, służący do zwalczania bombowców. Nie ukończono ani jednego egzemplarza seryjnego tej wersji, powstały jedynie dwa prototypy, Do 335M13 i Do 335M14. Po wojnie Do 335M14 wpadł w ręce Francuzów i był przez nich długo testowany. B-3 – ciężki myśliwiec dzienny będący rozwinięciem wersji B-2. Miał mieć wyposażenie pozwalające na zwalczanie bombowców na większych wysokościach. Nie ukończono ani jednego egzemplarza seryjnego tej wersji, powstały jedynie trzy prototypy, Do 335M18 do M20, ale żaden z nich nie został ukończony przed zakończeniem wojny. B-4 – niezrealizowany projekt samolotu rozpoznawczego, opartego na wersji A-4, ale ze zmianami typowymi dla wersji B oraz z nowymi skrzydłami. B-5 – niezrealizowany projekt samolotu treningowego. Miała to być wersja A-12 ze zmianami typowymi dla wersji B oraz z nowymi skrzydłami. B-6 – nocny myśliwiec wyposażony w zwykłe skrzydła oraz radar FuG 220, a w późniejszych maszynach FuG 218.