Nagle, w trakcie rozgrywek CBF zmieniło reguły i postanowiło, że mistrz i wicemistrz z obu modułów awansują do fazy barażowej. Z „modułu zielonego” były to CR Flamengo i SC Internacional, natomiast z „modułu żółtego” Sport Recife i Guarani FC. Kluby z silniejszego modułu odmówiły udziału w dodatkowych barażach, uważając się za mistrza i wicemistrza ligi Campeonato Brasileiro Série A, a CBF oskarżyły o zmianę reguł w trakcie sezonu. Uznały, że nie ma sensu rozgrywać meczów z mistrzem i wicemistrzem Série B, czyli niższej ligi.
Organizacje Clube dos 13 i CND (Conselho Nacional de Desportos) poparły stanowisko klubów CR Flamengo i SC Internacional i ogłosiły oba kluby mistrzem i wicemistrzem Brazylii w 1987.
Dla CONMEBOL, CBF i FIFA Sport Recife był mistrzem, a CR Flamengo i SC Internacional zostały zdyskwalifikowane.
W 1988 do Copa Libertadores dopuszczono mistrza i wicemistrza rozgrywek „modułu żółtego” – Sport Recife i Guarani FC.