Wśród racjonalnych tłumaczeń pochodzenia legendy jest między innymi hipoteza związana z epidemią dżumy, choroby, jak sądzono, roznoszonej przez szczury, ponieważ niedaleko Hameln odkryto masowy grób z połowy XIV wieku zawierający kilkaset szkieletów dzieci.
Wpływ W odcinku serialu Dawno, dawno temu, „Nasty Habits” (sezon 3, odcinek 4) wykorzystano motyw Flecisty z Hameln i połączono go z postacią Piotrusia Pana. Piotruś sprowadzał porzucone i osamotnione dzieci do siebie, a za pomocą magii zabierał je do Nibylandii, dając początek grupie „Zagubionych Chłopców”.
W serialu telewizyjnym Dolina Krzemowa Flecista z Hameln był inspiracją dla nazwy firmy prowadzonej przez bohaterów.
W Sadze o Ludziach Lodu pojawia się motyw Flecisty z Hameln. W tomie 16. „Kwiat Wisielców” bohaterowie poznają legendę szczurołapa i odkrywają, że jest ona ściśle powiązana z ich przodkiem Tengelem Złyn.
Film animowany The Electric Piper jest luźno oparty na tym podaniu ludowym.