W 80% przypadków choroba jest bezobjawowa, w 20% pozostałych przypadków występują komplikacje. Szacuje się, że wirus jest odpowiedzialny za około 5000 zgonów rocznie. Zgony w szpitalu, niezależnie od regionu, stwierdza się w 10–16% przypadków.
Po okresie inkubacji od 6 do 21 dni choroba zaostrza się atakując wiele organów wewnętrznych. Objawy gorączki są różne, a można zaliczyć do nich, opuchliznę twarzy, zmęczenie mięśni, jak również zapalenie spojówek i krwawienie ze śluzówek. Następne objawy powstają w wyniku zaatakowania organów wewnętrznych:
Układ pokarmowy nudności wymioty (krwawienie) biegunka (krwawienie) ból brzucha zaparcia dysfagia (utrudnione połykanie) zapalenie wątroby
Układ krążenia zapalenie osierdzia nadciśnienie niedociśnienie tachykardia (przyspieszenie akcji serca)
Układ oddechowy kaszel bóle w klatce piersiowej duszność zapalenie gardła zapalenie opłucnej
System nerwowy zapalenie mózgu zapalenie opon mózgowych jednostronna lub dwustronna utrata słuchu ataki, napady
Gorączka Lassa jest trudna do odróżnienia od innych wirusowych gorączek krwotocznych takich jak Ebola, Marburg lub od innych chorób powodujących gorączkę takich jak malaria.
Wirus jest obecny w kale i w moczu od 3 do 9 tygodni, a w nasieniu przez 3 miesiące.